Normalmente la trasferencia embrionaria se realiza los días 2-3 de desarrollo, cuando consta de 4-8 células. Sin embargo, existe la posibilidad de realizar la transferencia en día 5, momento en que el embrión consta de más de 100 células y es denominado blastocisto. Esta técnica suele aumentar la tasa de embarazo por embrión, pero hay que tener en cuenta la posibilidad que algunos embriones se bloqueen antes de llegar a blastocisto.

Esta técnica puede ser recomendada en pacientes con fallos previos de implantación, pacientes que no pueden permitirse una gestación múltiple (se transferiría un solo blastocisto) o cuando se quiere disminuir el número de embriones a congelar, ya que solo se congelarían aquellos que no llegaran a blastocisto.